自2005年建园以来，公园秉承"保护优先、科研支撑"的发展理念，长期与科研机构、高校保持深度合作，系统开展科学研究。联合江西省地质调查研究院（现江西省地质调查勘查院），完成了"三清山式"花岗岩地貌系统研究、世界地质公园申报论证及地质遗迹资源调查评价，形成了《三清山花岗岩地貌特征及成因》等系统性学术著作，为公园申遗成功及后续深入研究奠定了坚实基础；同时，依托中国地质科学院、中国地质大学（北京），深入研究了区域不同时代花岗岩的时空分布及4个主要岩浆活动期，探讨了花岗岩成因及其形成背景，完成博士论文《江西三清山花岗岩地质地貌特征及形成机制》，出版《三清山花岗岩地貌特征及成因》《江西三清山花岗岩地质地貌特征及形成机制》等专著，构建了从地貌表征到成因机制的完整研究体系。现将2012年至2025年间代表性科研论文汇编如下：
